『일본역사의 비밀』은 과거 일본인들의 발자취를 통해 현재와 미래에 대한 바른 이해를 도와주는 책이다. 통합과 개방의 민본중흥, 문화국가를 지향한 나량시대와 평안시대, 봉건영주를 꿈꾼 무사들의 전성시대, 천황과 나라밖 전쟁, 경제대국 선진일본을 창건한 주역들, 일본을 빛낸 노벨상수상자들로 구성되어 있다.
1. 통합과 개방의 민본중흥(民本中興): 7세기 중엽의 대화개신(大化改新)과 19세기 중엽의 명치유신(明治維新) (1) 7세기 식 민본중흥: 대화개신(大化改新: 다이카개신; 645-654)
(2) 19세기 식 민본중흥: 명치유신(明治維新: 메이지유신 1868.9-1912.7)
3. 봉건영주(封建領主)를 꿈꾼 무사(武士)들의 전성시대 (1) 최초의 무가정권(武家政權)인 원씨(源氏)와 북조씨(北條氏)의 겸창막부(鎌倉幕府: 가마쿠라바쿠후 1192-1333)
(2) 백 년의 전국시대(戰國時代: 15세기 중엽부터 16세기 중엽까지)를 낳은 족리씨(足利氏)의 실정막부(室町幕府: 무로마치바쿠후 1336-1573)
(3) 직전신장(織田信長)과 풍신수길(風臣秀吉)의 천하통일: 안토도산시대(安土桃山時代: 아즈치모모야마시대 1573-1598.8)
(4) 봉건(封建)과 근대(近代)의 징검다리: 덕천씨(德川氏)의 강호막부(江戶幕府: 에도바쿠후 1603-1867.10)
4. 천황(天皇)과 나라밖 전쟁 (1) 38대 천지천황(天智天皇)의 백제부흥전쟁(百濟復興戰爭) 참전
(2) 문록(文祿)―경장(慶長)의 대전란(1592.4-1598.11)을 치른 107대 후양성천황(後陽成天皇: 고요제이천황 재위 1586.11-1611.3)
(3) 청나라와 러시아를 무릎 꿇린 122대 명치천황(明治天皇: 재위 1867.1-1912.7)
(4) 임진왜란-정유재란(1592~1598년까지 2차에 걸쳐서 조선에 침입한 일본과의 전쟁. 일본의 2차 침입은 정유재란(丁酉再亂)이라고 한다)
(5) 1차 세계대전 승전국 일본과 123대 대정천황(大正天皇: 재위 1912.7-1926.12)
(6) 2차 세계대전 패전국 일본과 124대 소화천황(昭和天皇: 재위 1926.12-1989.1)
(7) UN 평화유지군 속의 일본 자위대와 125대 평성천황(平成天皇: 재위 1989.1-현재)
